En Baelo existen dos necrópolis, una al este y otra al oeste, ambas fuera del recinto amurallado de la ciudad. En la necrópolis este se ha encontrado una gran variedad de enterramientos. Se usó fundamentalmente la incineración, conservando las cenizas en urnas de barro cocido, plomo, piedra tallada, etc. Estas urnas, además, contenían diversos objetos: espejos de mano, monedas, ungüentarios, punzones, anzuelos de pesca, etc. También se conservan varias fosas de los últimos tiempos del Imperio Romano, época en que se retomó la tradición del enterramiento de cadáveres.

Lo más interesante de estas necrópolis son unos bustos de piedra muy toscamente elaborados, que parecen representar una figura humana. Estos bustos aparecen en todas las tumbas, tanto las de los pobres como en los ricos mausoleos, así como en todas las épocas, y siempre orientados de cara al mar. En algunas sepulturas se sustituían por una piedra lisa con la misma orientación. Esta disposición hace pensar en un rito de origen púnico, por su enorme similitud con la piedra sagrada o "betylo" de los fenicios.